10月31日，由内蒙古医科大学附属医院团队与来自9家医院的医疗队员先行组成了一支204人的医疗队伍，于当晚22时正式开舱，收治了第一批患者。到11月22日下午医院休舱前，进舱工作的医护人员共324名，来自17所医院。

　　关舱前，为确保水岸小镇2号方舱医院剩余患者安全转运，舱内工作人员对舱内物资、仪器、设备等进行彻底清点并妥善安置的同时，水岸小镇2号方舱医院指挥部与长途客运东站方舱医院指挥部在线上召开了转运工作会商会议，共同制定转运方案。对舱内剩余患者采用“按楼层分组转运”，所有患者由警车及120护送至长途客运东站方舱医院后，统一安置在两个病区。为保证医疗救治、护理工作的延续性，水岸小镇2号方舱医院工作人员随患者一同转移至长途客运东站方舱医院。