秦朝是中国历史上第一个统一的封建王朝，筑长城、凿灵渠，地方上废除分封制，代以郡县制 。

　　秦长城的修筑，标志着秦朝开始对今内蒙古南部长城以内地区的有效管辖。其中辖境涉及今内蒙古地区的有九原郡、云中郡、上郡、北地郡等。

　　九原郡，治所九原，今包头市西郊麻池古城，辖境包括今杭锦后旗、临河区、五原县、乌拉特前旗及黄河南岸的鄂尔多斯市北部地区。

　　云中郡，郡治在今托克托县古城村古城，辖今呼和浩特市区、托克托县、和林格尔县、清水河县和鄂尔多斯市东北部分地区。

　　上郡，郡治肤施，今陕西省榆林县东南，辖境包括今鄂尔多斯市东部准格尔旗西南、伊金霍洛旗、乌审旗一带。

　　北地郡，郡治在今甘肃省庆阳市西南，辖今乌海市和鄂尔多斯市西南部鄂托克旗、鄂托克前旗。

　　雁门郡，郡治善无，今山西省右玉县南，辖境包括今乌兰察布市南部地区。

　　代郡，治所在今河北省蔚县西南，辖境包括今乌兰察布市丰镇市、兴和县部分地区。

　　辽西郡，治所阳东，今奈曼旗沙巴营古城，辖境包括今通辽市南部、科左后旗、库伦旗、奈曼旗等地。

　　右北平郡，治所平刚，今赤峰市宁城县甸子乡黑城村古城外罗城，辖境包括今赤峰市南部松山区、宁城县、喀喇沁旗、敖汉旗等。

　　上谷郡，治所沮阳，今河北省怀来县东南，辖境包括今锡林郭勒盟正蓝旗、太仆寺旗等地。

　　渔阳郡，治所在今北京市密云县西南，辖境包括今锡林郭勒盟南部的旗县。

　　由上述可以看出，秦朝的郡县制是对春秋战国以来，特别是对战国时期各诸侯国所设郡县的沿袭。不同的是，在春秋时期，郡多设于边地，县多设于内地。

　　秦朝设立郡县，是为了强化对区域的管理。秦代在全国范围内制定和实施书同文、车同轨、统一货币、统一度量衡等，并得到了很好的贯彻执行，从而加速了这些区域与中原经济文化的交流融合，促进了经济的开发。如敖汉旗四家子老虎山遗址等地，多次出土秦半两钱、铁权、陶量及诏书、铭文，以及铁锄、铁铲等。这些出土的文物证明，秦长城南侧，今内蒙古东、西部地区，广泛分布着城镇、村庄。长城沿线的军事屯戍点的城、障、烽、燧，逐渐演变成为居民点、贸易点。如托克托县古城村古城、和林格尔县土城子古城、准格尔旗勿尔图沟城址、宁城县黑城子城址、奈曼旗沙巴营子城址等。

　　秦朝在边地设置郡县的同时，从内地迁徙人口，移民屯垦，从而促进了阴山区域黄河沿线人口的增加、土地的开发和经济的发展。

　　秦朝边郡，见证古代各民族交往交流交融，见证中华文明多元融合。