1997年，巴彦淖尔市中心血站成立，为全市7个旗县区20余家医疗机构统一提供临床和急救用血。在此前，全市的临床用血主要依靠各医院自采自供，临床用血管理不规范，直接威胁到用血患者的健康和安全。一切从零开始，面对重重困难，血站人迎难而上，走上了“动员全社会、服务所有人”的振兴之路。中心血站历时三个月初步建立了覆盖血站各项工作全过程的质量管理体系，从管理职责、资源配置、人才培养、规范运行与持续改进等各方面进行了全面升级，实现了采供血工作运行规范化、科学化管理。通过定期开展内部质量审核，有效地保障了出库血液制品的合格率为100%。20多年来，该市未发生过一例经血传播疾病的事件，没有出现任何采供血差错事故。
无偿献血是临床救治患者医疗用血的唯一来源。为了充分调动社会各界参与无偿献血的热情，血站积极采取多种措施，不断加大无偿献血的推行力度。《献血法》实施20年来，巴彦淖尔市无偿献血工作始终保持着稳步发展的良好势头，全市无偿献血从1997年的不足1000人次，快速增长至2012年的近1.5万人次，曾经四次获得国家无偿献血先进城市奖，累计有1429人获得过国家和自治区无偿献血奉献金、银、铜奖，市中心血站也先后荣获过自治区无偿献血先进集体奖和全区无偿献血促进奖。
